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醫(yī)械創(chuàng)新資訊
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【CMDE】胚胎植入前染色體非整倍體檢測(cè)試劑盒(可逆末端終止測(cè)序法)注冊(cè)技術(shù)審評(píng)報(bào)告發(fā)布

日期:2021-11-23
瀏覽量:2266
體外診試劑產(chǎn)注冊(cè)技術(shù)審評(píng)報(bào)告

產(chǎn)品中文名稱:胚胎植入前染色體非整倍體檢測(cè)試劑盒(可逆末端終止測(cè)序)
產(chǎn)品管理類(lèi)別:第三類(lèi)
申請(qǐng)人名稱:北京中儀康衛(wèi)醫(yī)療器械有限公司

國(guó)家藥品監(jiān)督管理局?
醫(yī)療器械技術(shù)審評(píng)中心

基本信息
?

一、 申請(qǐng)人名稱

北京中儀康衛(wèi)醫(yī)療器械有限公司

二、申請(qǐng)人住所

北京市大興區(qū)中關(guān)村科技園區(qū)大興生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)基地天榮街19號(hào)院6幢204室

三、生產(chǎn)地址

北京市大興區(qū)中關(guān)村科技園區(qū)大興生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)基地天榮街19號(hào)院6幢204室


技術(shù)評(píng)概述
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一、產(chǎn)品概述
(一)產(chǎn)品主組成成
劑盒體組成分、套試劑見(jiàn)說(shuō)明書(shū)。

(二)產(chǎn)品預(yù)期用途
本產(chǎn)品用于定性檢測(cè)試管嬰兒過(guò)程中體外培養(yǎng)胚胎的囊胚滋養(yǎng)層細(xì)胞的脫氧核糖核酸(DNA),通過(guò)對(duì)胚胎部分細(xì)胞的DNA進(jìn)行檢測(cè),分析胚胎染色體是否存在非整倍體數(shù)量異常,輔助臨床醫(yī)生判斷胚胎是否植入。
本產(chǎn)品適用于女性年齡38歲及以上進(jìn)行試管嬰兒的患者;夫妻雙方或一方存在染色體異常的患者;三次以上的試管嬰兒植入失敗者;三次以上自然流產(chǎn)患者;生育過(guò)染色體異常患兒的夫婦。
檢測(cè)結(jié)果僅供參考,不單獨(dú)作為確診的依據(jù),本產(chǎn)品不用于拷貝數(shù)變異的檢測(cè)。
(三)產(chǎn)品包裝規(guī)格
42測(cè)試/盒、96測(cè)試/盒
(四)產(chǎn)品檢驗(yàn)原理
該試劑盒是利用全基因組擴(kuò)增技術(shù)對(duì)從囊胚期胚胎獲得的細(xì)胞進(jìn)行擴(kuò)增,利用可逆末端終止高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行全基因組測(cè)序,通過(guò)生物信息軟件對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,判斷胚胎是否存在染色體非整倍體異常。
胚胎細(xì)胞全基因組擴(kuò)增通過(guò)低擴(kuò)增偏好的方式進(jìn)行,以盡可能無(wú)偏倚地保持樣本原始DNA信息。擴(kuò)增分三步進(jìn)行:裂解,預(yù)擴(kuò)增和擴(kuò)增。對(duì)胚胎細(xì)胞裂解后,使用具有特殊結(jié)構(gòu)的隨機(jī)引物及配套組分對(duì)基因組進(jìn)行預(yù)擴(kuò)增,形成結(jié)構(gòu)相對(duì)穩(wěn)定的預(yù)擴(kuò)增產(chǎn)物,最后使用與預(yù)擴(kuò)增引物的非隨機(jī)部分的序列匹配的擴(kuò)增引物及配套組分對(duì)基因組進(jìn)行指數(shù)擴(kuò)增。
文庫(kù)構(gòu)建時(shí),對(duì)全基因組擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行片段化和接頭連接,采用PCR擴(kuò)增的方法對(duì)片段化產(chǎn)物加入標(biāo)簽序列并實(shí)現(xiàn)文庫(kù)的富集。最后,通過(guò)XP磁珠完成對(duì)文庫(kù)的純化,完成文庫(kù)構(gòu)建。
該試劑盒結(jié)合可逆末端終止測(cè)序技術(shù)和生物信息學(xué)分析方法,基于新一代的高通量測(cè)序平臺(tái),對(duì)胚胎囊胚期活檢細(xì)胞中染色體數(shù)目異常進(jìn)行定性檢測(cè)。可逆末端終止測(cè)序技術(shù)的檢測(cè)過(guò)程包括:將不同熒光基團(tuán)標(biāo)記的四種脫氧核苷酸以及DNA聚合酶同時(shí)加入流動(dòng)槽通道中,按堿基互補(bǔ)原理,合成互補(bǔ)的DNA鏈;在堿基延伸過(guò)程中,每個(gè)循環(huán)中合成反應(yīng)只能延伸一個(gè)正確互補(bǔ)的堿基,根據(jù)四種不同的熒光信號(hào)確認(rèn)堿基種類(lèi),讀取該次反應(yīng)顏色后,堿基保護(hù)基團(tuán)被除去,下一個(gè)反應(yīng)可繼續(xù)進(jìn)行;最終,通過(guò)對(duì)所有測(cè)序信號(hào)的分析,實(shí)現(xiàn)對(duì)DNA序列各個(gè)位點(diǎn)不同堿基的序列判定;并結(jié)合生物信息學(xué)分析方法,對(duì)人染色體所屬的DNA片段數(shù)量進(jìn)行統(tǒng)計(jì),將統(tǒng)計(jì)的結(jié)果與大量正常樣本構(gòu)成的參考集合相比較,即可獲得檢測(cè)樣本中所含染色體DNA片段數(shù)量是否存在異常,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)人胚胎23對(duì)染色體數(shù)目異常的判斷。
二、臨床前研究概述
(一)主要原材料
1.主要原材料的選擇
該試劑盒主要原材料包括:無(wú)核酸酶水、裂解液、裂解酶緩沖液、裂解酶、預(yù)擴(kuò)增緩沖液、預(yù)擴(kuò)增酶、擴(kuò)增緩沖液、擴(kuò)增酶、文庫(kù)構(gòu)建試劑、PCR擴(kuò)增試劑、標(biāo)簽序列、測(cè)序試劑、流動(dòng)槽、雜交緩沖液、PR2反應(yīng)緩沖液及對(duì)照品等。這些原材料均為外購(gòu)方式獲得,對(duì)照品由細(xì)胞供應(yīng)商提供,并由申請(qǐng)人制備獲得。申請(qǐng)人對(duì)主要原材料進(jìn)行了供應(yīng)商選擇,通過(guò)功能性試驗(yàn),篩選出最佳的原材料供應(yīng)商,制定了主要原材料質(zhì)量要求并經(jīng)檢驗(yàn)合格。
2.企業(yè)參考品和對(duì)照品設(shè)置情況
企業(yè)參考品包括陽(yáng)性參考品、陰性參考品、嵌合體參考品、數(shù)據(jù)量控制參考品。陽(yáng)性參考品20份,是由多種染色體非整倍體陽(yáng)性細(xì)胞樣本組成;陰性參考品3份,是由染色體非整倍體陰性細(xì)胞樣本組成;嵌合體參考品6份,是由兩種不同染色體拷貝數(shù)變異樣本混合制備的細(xì)胞樣本組成;數(shù)據(jù)量控制參考品1份,由YH細(xì)胞樣本組成。
對(duì)照品是由2份陽(yáng)性對(duì)照品和1份陰性對(duì)照品組成,用于檢測(cè)過(guò)程中試劑和儀器的質(zhì)量控制。其中陽(yáng)性對(duì)照品是由染色體非整倍體陽(yáng)性細(xì)胞樣本(21三體和XO)組成;陰性對(duì)照品是由染色體非整倍體陰性細(xì)胞樣本組成。
(二)生產(chǎn)工藝及反應(yīng)體系研究
申請(qǐng)人通過(guò)使用初步確定的配方進(jìn)行反應(yīng)體系配制,對(duì)反應(yīng)體系中細(xì)胞裂解、預(yù)擴(kuò)增、擴(kuò)增、片段化、PCR擴(kuò)增等步驟,對(duì)標(biāo)簽序列、雜交緩沖液、PR2反應(yīng)緩沖液、上機(jī)文庫(kù)濃度、樣本用量等關(guān)鍵步驟進(jìn)行不同反應(yīng)條件的篩選,確定了最優(yōu)的反應(yīng)條件。通過(guò)功能性試驗(yàn)和生產(chǎn)工藝研究,確定了最佳的生產(chǎn)工藝和反應(yīng)體系。
(三)分析性能評(píng)估
分析性能評(píng)估內(nèi)容包括樣本穩(wěn)定性、樣本類(lèi)型的研究分析、染色體非整倍體陽(yáng)性符合率、微缺失微重復(fù)符合率、陰性符合率、嵌合體符合率、數(shù)據(jù)量控制、重復(fù)性、精密度、分析特異性。
1.樣本穩(wěn)定性研究:申請(qǐng)人對(duì)胚胎細(xì)胞樣本的儲(chǔ)存穩(wěn)定性、凍融次數(shù)進(jìn)行了研究,最終確定細(xì)胞樣本-20±5℃保存時(shí)間不超過(guò)3個(gè)月;樣本反復(fù)凍融次數(shù)不超過(guò)1次。
申請(qǐng)人對(duì)細(xì)胞樣本的全基因組擴(kuò)增產(chǎn)物儲(chǔ)存穩(wěn)定性進(jìn)行了研究,最終確定全基因組擴(kuò)增產(chǎn)物于-70±10℃或-20±5℃環(huán)境保存不超過(guò)2個(gè)月。
2.樣本類(lèi)型研究:申請(qǐng)人對(duì)樣本用量進(jìn)行了研究,細(xì)胞樣本的樣本用量為1~20個(gè)細(xì)胞時(shí),均能夠滿足檢測(cè)要求??紤]臨床囊胚活檢樣本的可獲得性,最終確定適用于本產(chǎn)品的囊胚滋養(yǎng)層活檢樣本的細(xì)胞數(shù)目為3~10個(gè)。
3.染色體非整倍體陽(yáng)性檢測(cè)符合率:對(duì)連續(xù)三批生產(chǎn)的試劑盒采用16份染色體非整倍體陽(yáng)性樣本進(jìn)行檢測(cè),檢測(cè)結(jié)果表明染色體非整倍體陽(yáng)性符合率為100%;使用國(guó)家參考品中的非整倍體陽(yáng)性參考品檢測(cè),符合率100%。
4.微缺失微重復(fù)檢測(cè)符合率:該產(chǎn)品對(duì)微缺失微重復(fù)的檢出情況進(jìn)行了分析性能評(píng)估;使用國(guó)家參考品中的微缺失微重復(fù)參品檢測(cè),符合該指標(biāo)。
5.陰性檢測(cè)符合率:對(duì)連續(xù)三批生產(chǎn)的試劑盒采用7份陰性樣本進(jìn)行檢測(cè),檢測(cè)結(jié)果表明陰性符合率為100%;使用國(guó)家參考品中的陰性參考品檢測(cè),符合率? ?100%。
6.嵌合體檢測(cè)符合率:對(duì)連續(xù)三批生產(chǎn)的試劑盒采用6 ?份嵌合樣本進(jìn)行檢測(cè),檢測(cè)結(jié)果表明對(duì)30% 嵌合的嵌合體樣本符合率達(dá)到30%以上;70%嵌合體符合率達(dá)到60%以上;使用國(guó)家參考品中的嵌合體參考品檢測(cè),符合該指標(biāo)。
7.數(shù)據(jù)量控制檢測(cè):對(duì)連續(xù)三批生產(chǎn)的試劑盒采用1份企業(yè)數(shù)據(jù)量控制參考品進(jìn)行檢測(cè),檢測(cè)結(jié)果表明數(shù)據(jù)量控制參考品的檢測(cè)有效數(shù)據(jù)量不低于1M,基因組覆蓋率不低于4%;使用國(guó)家參考品中的數(shù)據(jù)量控制參考品檢測(cè),符合該指標(biāo)。
8.重復(fù)性:對(duì)連續(xù)三批生產(chǎn)的試劑盒分別進(jìn)行三次上述的染色體非整倍體陽(yáng)性檢測(cè)符合率試驗(yàn)、微缺失微重復(fù)檢測(cè)符合率試驗(yàn)、陰性檢測(cè)符合率試驗(yàn)、嵌合體檢測(cè)符合率試驗(yàn)、數(shù)據(jù)量控制檢測(cè)試驗(yàn),檢測(cè)結(jié)果表明重復(fù)性均滿足技術(shù)要求規(guī)定的性能指標(biāo)。
9.精密度:對(duì)連續(xù)三批生產(chǎn)的試劑盒采用企業(yè)參考品分別在兩個(gè)不同的實(shí)驗(yàn)室、分別選用兩位不同的操作者在兩臺(tái)不同的測(cè)序儀進(jìn)行檢測(cè),每批試劑盒檢測(cè)三次,檢測(cè)結(jié)果表明不同實(shí)驗(yàn)室間重復(fù)性、不同操作者重復(fù)性、不同測(cè)序儀重復(fù)性的檢測(cè)均滿足技術(shù)要求規(guī)定的性能指標(biāo)。
10.分析特異性:對(duì)連續(xù)三批生產(chǎn)的試劑盒采用60份染色體
微缺失微重復(fù)樣本進(jìn)行檢測(cè),均未檢測(cè)出非整倍體;對(duì)三批生產(chǎn)的試劑盒采用9份已知存在染色體微缺失微重復(fù)的非整倍體樣本進(jìn)行檢測(cè),均檢測(cè)出應(yīng)檢出的非整倍體;檢測(cè)結(jié)果表明分析特異性達(dá)到100%。
(四)陽(yáng)性判斷值或參考區(qū)間研究
申請(qǐng)人采用已知染色體非整倍體陰性樣本構(gòu)建參考數(shù)據(jù)庫(kù),然后采用已知的染色體非整倍體陰性樣本及模擬數(shù)據(jù)建立參考范圍,并用400例已知核型樣本進(jìn)行參考范圍的確定,最終確定的染色體非整倍體陰性樣本的染色體的檢測(cè)信號(hào)值(RCid)的參考范圍為12.97<RCid<26.97,染色體非整倍體陽(yáng)性樣本的RCid的參考范圍為:RCid大于等于26.97或小于等于12.97。
具體過(guò)程如下,通過(guò)350例染色體非整倍體陰性樣本檢測(cè)數(shù)據(jù)和4400例染色體組成異常的模擬數(shù)據(jù)構(gòu)建參考數(shù)據(jù)庫(kù),計(jì)算其中每個(gè)樣本的24條染色體的RCid值,利用Z值法對(duì)Rcid值區(qū)間進(jìn)行劃分,并使用該試劑盒對(duì)400例染色體非整倍體陰性樣本和染色體非整倍體陽(yáng)性樣本進(jìn)行驗(yàn)證,從而最終確定參考值的范圍。
(五)試劑盒穩(wěn)定性研究
申請(qǐng)人對(duì)該試劑盒的長(zhǎng)期穩(wěn)定性、開(kāi)瓶穩(wěn)定性、凍融穩(wěn)定性、運(yùn)輸穩(wěn)定性進(jìn)行了研究,確定了在各種條件下該試劑盒的有效保存時(shí)間。長(zhǎng)期穩(wěn)定性試驗(yàn):取連續(xù)三批生產(chǎn)的試劑盒,將試劑盒置于儲(chǔ)存環(huán)境中,分別于第0、3、6、7個(gè)月取出,對(duì)試劑盒的性能指標(biāo)進(jìn)行檢測(cè),確定該試劑盒在其儲(chǔ)存環(huán)境下的有效期為6個(gè)月。
開(kāi)瓶穩(wěn)定性和凍融穩(wěn)定性試驗(yàn):取連續(xù)三批生產(chǎn)的試劑盒,將試劑盒開(kāi)瓶后置于儲(chǔ)存環(huán)境中,于0、1、2、3、4、5、6個(gè)月對(duì)試劑盒的性能指標(biāo)進(jìn)行檢測(cè),同時(shí),在整個(gè)穩(wěn)定性考察時(shí),有效期內(nèi)的反復(fù)凍融次數(shù)為6次,考察產(chǎn)品經(jīng)過(guò)反復(fù)凍融后,其產(chǎn)品性能有無(wú)變化。最終確定該試劑盒開(kāi)瓶后可以穩(wěn)定存放3個(gè)月,反復(fù)凍融≤5次。
運(yùn)輸穩(wěn)定性試驗(yàn):取連續(xù)三批生產(chǎn)的試劑盒,將試劑盒按照儲(chǔ)存溫度要求采用冷鏈運(yùn)輸,運(yùn)輸時(shí)長(zhǎng)為4天,分別于運(yùn)輸前、退回公司后及有效期末對(duì)試劑盒的性能指標(biāo)進(jìn)行檢測(cè),確定該試劑盒運(yùn)輸時(shí)限為3天。
三、臨床評(píng)價(jià)概述
申請(qǐng)人在中信湘雅生殖與遺傳??漆t(yī)院、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬仁濟(jì)醫(yī)院、山東大學(xué)附屬生殖醫(yī)院、中國(guó)福利院國(guó)際和平婦幼保健院四家臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu)開(kāi)展了臨床試驗(yàn)。臨床試驗(yàn)采用考核試劑與臨床參考方法進(jìn)行比較研究的試驗(yàn)方法,確認(rèn)考核試劑的臨床有效性??己嗽噭z測(cè)陽(yáng)性的胚胎,對(duì)比確認(rèn)方法為FISH;考核試劑檢測(cè)陰性的胚胎,對(duì)比確認(rèn)方法為染色體核型分析,包括產(chǎn)前診斷羊水、流產(chǎn)組織或新生兒臍帶血的核型分析。
臨床試驗(yàn)共入組 1221 對(duì)符合適應(yīng)癥的受試者,考核試劑共檢測(cè)4640 例胚胎,檢測(cè)出陽(yáng)性胚胎樣本 1494 例,陰性胚胎樣本3135 例,11 例未獲得有效檢測(cè)結(jié)果。其中陽(yáng)性樣本總共完成 632例 FISH 驗(yàn)證,99 例陽(yáng)性樣本由于未觀察到細(xì)胞樣本、檢測(cè)無(wú)結(jié)果或 FISH 試劑過(guò)期而脫落,共納入統(tǒng)計(jì) 533 例陽(yáng)性胚胎。其中Chr13、Chr16、Chr18、Chr21 以及性染色體陽(yáng)性驗(yàn)證例數(shù)為:Chr13(59 例)、Chr16(53 例)、Chr18(41 例)、Chr21(61 例)、 性染色體(47 例);陰性胚胎樣本有 1058 例進(jìn)行了植入,569 例 成功妊娠,獲得 231 例核型分析檢查結(jié)果(其中羊水穿刺核型分析222例,流產(chǎn)組織核型分析1例,因方案偏離等原因剔除8例),共納入223例陰性胚胎。
通過(guò)對(duì)以上共533例FISH確認(rèn)的陽(yáng)性樣本以及223例核型分析確認(rèn)的陰性樣本統(tǒng)計(jì)分析,待考評(píng)試劑盒的靈敏性為100%(95%CI:99.3%~100%),特異性為98.2%(95%CI:95.6%~99.5%)。陽(yáng)性預(yù)測(cè)值為99.2%(95%CI:98.1%~99.8%),陰性預(yù)測(cè)值為100.00%(95%CI:98.4%~100.00%)。由于本臨床試 驗(yàn)無(wú)法對(duì)所有陰性樣本以及陽(yáng)性樣本全部進(jìn)行驗(yàn)證的特點(diǎn),通過(guò) 對(duì)受試者的基線特征和入組胚胎的基線特征進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)受試者基線和入組胚胎基線在已驗(yàn)證與未驗(yàn)證樣本中均不具有顯著差 異,可以認(rèn)為在本產(chǎn)品檢測(cè)結(jié)果的統(tǒng)計(jì)中,完成驗(yàn)證的樣本能夠 代表總體樣本。
根據(jù)2002年衛(wèi)生部頒發(fā)的《胎兒染色體核型分析技術(shù)規(guī)范》要求核型分析的準(zhǔn)確率不低于98%。對(duì)已完成驗(yàn)證的樣本進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,得出本產(chǎn)品總符合率為99.5%;利用基于二項(xiàng)分析的統(tǒng)計(jì)算法得出所有樣本的陽(yáng)性預(yù)測(cè)值為99.2%,陰性預(yù)測(cè)值為100.0%,因此參考上述規(guī)范的要求,可認(rèn)為該產(chǎn)品達(dá)到了臨床診斷的準(zhǔn)確性要求。
綜上所述,該產(chǎn)品臨床試驗(yàn)資料對(duì)產(chǎn)品的臨床性能進(jìn)行了全面研究,臨床試驗(yàn)結(jié)果基本符合臨床應(yīng)用要求。申請(qǐng)人需在該產(chǎn)品上市后進(jìn)一步完成以下工作:上市后需繼續(xù)搜集至少10家臨床機(jī)構(gòu)、全部臨床使用數(shù)據(jù)作為臨床補(bǔ)充資料在產(chǎn)品下一次延續(xù)注冊(cè)時(shí)提交,繼續(xù)收集各染色體檢測(cè)異常情況(本試劑檢測(cè)陽(yáng)性)及植入后(本試劑檢測(cè)陰性)結(jié)果情況,植入后的胚胎繼續(xù)追蹤其與臨床參考方法的檢測(cè)結(jié)果(核型分析/出生隨訪)的對(duì)比情況。該項(xiàng)臨床資料應(yīng)當(dāng)由出具數(shù)據(jù)各臨床機(jī)構(gòu)簽章。
四、產(chǎn)品收益風(fēng)險(xiǎn)判定
根據(jù)“YY/T0316-2016醫(yī)療器械風(fēng)險(xiǎn)管理對(duì)醫(yī)療器械的應(yīng)用”標(biāo)準(zhǔn),對(duì)該產(chǎn)品進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)分析。
(一)受益評(píng)估
本產(chǎn)品用于定性檢測(cè)試管嬰兒過(guò)程中體外培養(yǎng)胚胎的囊胚滋養(yǎng)層細(xì)胞的脫氧核糖核酸(DNA),通過(guò)對(duì)胚胎部分細(xì)胞的DNA進(jìn)行檢測(cè),分析胚胎染色體是否存在非整倍體數(shù)量異常,輔助臨床醫(yī)生判斷胚胎是否植入。本產(chǎn)品適用于女性年齡38歲及以上進(jìn)行試管嬰兒的患者;夫妻雙方或一方存在染色體異常的患者;三次以上的試管嬰兒植入失敗者;三次以上自然流產(chǎn)患者;生育過(guò)染色體異常患兒的夫婦。上述人群是胚胎染色體非整倍體高發(fā)人群,通過(guò)檢測(cè)結(jié)果來(lái)輔助判斷胚胎是否植入,減少因植入異常胚胎而造成的反復(fù)種植失敗、反復(fù)流產(chǎn)、出生缺陷等,減少患者生理、心理傷害及社會(huì)經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)。
(二)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估
該試劑盒檢測(cè)結(jié)果會(huì)受到樣本來(lái)源、樣本采集過(guò)程、樣本運(yùn)輸條件等樣本因素的影響,同時(shí)也受到試驗(yàn)操作、試驗(yàn)環(huán)境、試劑儲(chǔ)存等試驗(yàn)因素的影響,可能導(dǎo)致數(shù)據(jù)質(zhì)量降低或檢測(cè)失敗。使用者須了解檢測(cè)過(guò)程中可能存在的潛在風(fēng)險(xiǎn)及檢測(cè)的局限性,詳見(jiàn)產(chǎn)品說(shuō)明書(shū)中【檢驗(yàn)方法的局限性】。
不符合該試劑盒說(shuō)明書(shū)中【樣本要求】的樣本或不恰當(dāng)?shù)脑囼?yàn)操作會(huì)導(dǎo)致數(shù)據(jù)質(zhì)量降低或檢測(cè)失敗,請(qǐng)嚴(yán)格按照產(chǎn)品說(shuō)明書(shū)中【樣本要求】及【檢驗(yàn)方法】的要求操作和進(jìn)行試驗(yàn)過(guò)程質(zhì)控。
該試劑盒在檢測(cè)過(guò)程中涉及基因擴(kuò)增,在非可控的實(shí)驗(yàn)室操作可能由于環(huán)境中氣溶膠的存在導(dǎo)致結(jié)果不可靠,同時(shí)PCR操作過(guò)程中氣溶膠的泄露可能會(huì)導(dǎo)致設(shè)備甚至實(shí)驗(yàn)室的污染。因此,請(qǐng)?jiān)诳煽氐膶?shí)驗(yàn)室進(jìn)行檢測(cè)操作,操作人員必須進(jìn)行專業(yè)培訓(xùn),嚴(yán)格按照說(shuō)明書(shū)操作。
在現(xiàn)有技術(shù)條件下,該產(chǎn)品檢測(cè)結(jié)果僅輔助醫(yī)生判斷胚胎是否植入,胚胎植入后還將按照體外輔助生殖相關(guān)診療規(guī)程對(duì)植入胚胎的情況進(jìn)行產(chǎn)前檢測(cè)和產(chǎn)前診斷等。
(三)受益-風(fēng)險(xiǎn)的確定
通過(guò)環(huán)境控制、生產(chǎn)監(jiān)控、成品檢驗(yàn)和增加說(shuō)明書(shū)警示內(nèi)容等防范措施,對(duì)該試劑盒的已知和可預(yù)見(jiàn)的安全風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)行控制和降低,剩余風(fēng)險(xiǎn)可以被控制在可接受范圍內(nèi),同時(shí)沒(méi)有帶來(lái)新的危害與安全風(fēng)險(xiǎn)。在目前認(rèn)知水平上,認(rèn)為該試劑盒上市帶來(lái)的受益大于風(fēng)險(xiǎn)。盡管目前認(rèn)為該試劑盒的受益大于風(fēng)險(xiǎn),但是為保證用械安全,基于對(duì)主要剩余風(fēng)險(xiǎn)的防控,已在該試劑盒說(shuō)明書(shū)中提示以下信息:
1.預(yù)期用途:該試劑盒適用于女性年齡38歲及以上進(jìn)行試管嬰兒的患者;夫妻雙方或一方存在染色體異常的患者;三次以上的試管嬰兒植入失敗者;三次以上自然流產(chǎn)患者;生育過(guò)染色體異常患兒的夫婦。
2.警示及注意事項(xiàng):該試劑盒說(shuō)明書(shū)中明確了該試劑盒【檢驗(yàn)方法的局限性】及使用中的【注意事項(xiàng)】。
?
綜合評(píng)價(jià)意見(jiàn)
?
本申報(bào)項(xiàng)目為境內(nèi)第三類(lèi)醫(yī)療器械產(chǎn)品注冊(cè),屬于創(chuàng)新醫(yī)療器械(編號(hào):201600088)。申請(qǐng)人的注冊(cè)申報(bào)資料符合現(xiàn)行要求,依據(jù)《醫(yī)療器械監(jiān)督管理?xiàng)l例》(國(guó)務(wù)院令第680號(hào))、《體外診斷試劑注冊(cè)管理辦法》(國(guó)家食品藥品監(jiān)督管理總局令2014年第5號(hào))等相關(guān)醫(yī)療器械法規(guī)與配套規(guī)章,經(jīng)系統(tǒng)評(píng)價(jià)后,建議準(zhǔn)予注冊(cè)。申請(qǐng)人在該產(chǎn)品上市后需繼續(xù)搜集至少10家臨床機(jī)構(gòu)、全部臨床使用數(shù)據(jù)作為臨床補(bǔ)充資料在產(chǎn)品下一次延續(xù)注冊(cè)時(shí)提交,繼續(xù)收集各染色體檢測(cè)異常情況(本試劑檢測(cè)陽(yáng)性)及植入后(本試劑檢測(cè)陰性)結(jié)果情況,植入后的胚胎繼續(xù)追蹤其與金標(biāo)準(zhǔn)檢測(cè)結(jié)果(核型分析/出生隨訪)的對(duì)比情況。該項(xiàng)臨床資料應(yīng)當(dāng)由出具數(shù)據(jù)各臨床機(jī)構(gòu)簽章。?

附件:產(chǎn)品說(shuō)明書(shū)
胚胎植入前染色體非整倍體檢測(cè)試劑盒
(可逆末端終止測(cè)序法)說(shuō)明書(shū)
?
【產(chǎn)品名稱】
通用名稱:胚胎植入前染色體非整倍體檢測(cè)試劑盒(可逆末端終止測(cè)序法)?
【包裝規(guī)格】
?42 測(cè)試/盒、96 測(cè)試/盒
【預(yù)期用途】
本產(chǎn)品用于定性檢測(cè)試管嬰兒過(guò)程中體外培養(yǎng)胚胎的囊胚滋養(yǎng)層細(xì)胞的脫氧核糖核酸(DNA),通過(guò)對(duì)胚胎部分細(xì)胞的DNA進(jìn)行檢測(cè),分析胚胎染色體是否存在非整倍體數(shù)量異 常,輔助臨床醫(yī)生判斷胚胎是否植入。本產(chǎn)品適用于女性年齡38歲及以上進(jìn)行試管嬰兒的患 者;夫妻雙方或一方存在染色體異常的患者;三次以上的試管嬰兒植入失敗者;三次以上自然流產(chǎn)患者;生育過(guò)染色體異常患兒的夫婦。
?染色體非整倍體是指單個(gè)染色體或多個(gè)染色體數(shù)目的增加或減少,是臨床上最常見(jiàn)的染色 體數(shù)目異常。試管嬰兒體外受精的胚胎中容易發(fā)生染色體非整倍體異常,異常胚胎植入女性子宮 可導(dǎo)致種植失敗、流產(chǎn)、出生缺陷等問(wèn)題,通過(guò)胚胎植入前染色體非整倍體異常檢測(cè)(PreimplantationGeneticTestingforAneuploidies,PGT-A)可以減少植入染色體數(shù)目異常的胚胎,減 少因植入異常胚胎而造成的反復(fù)種植失敗、反復(fù)流產(chǎn)、出生缺陷等。臨床常見(jiàn)的染色體非整倍體 檢測(cè)技術(shù)包括熒光原位雜交技術(shù)(FluorescenceInSituHybridization,FISH),微陣列比較基因組雜交 技術(shù)(ComparativeGenomicHybridization,Array-CGH),單核苷酸多態(tài)性芯片檢測(cè)技術(shù)(Single NucleotidePolymorphism,SNP-Array)。
檢測(cè)結(jié)果僅供參考,不單獨(dú)作為確診的依據(jù),本產(chǎn)品不用于拷貝數(shù)變異的檢測(cè)。?
【檢驗(yàn)原理】
人類(lèi)早期胚胎會(huì)發(fā)生較高頻率的染色體異常,其中以染色體非整倍體最常見(jiàn)。通過(guò)高通量 測(cè)序技術(shù)對(duì)胚胎細(xì)胞染色體DNA進(jìn)行檢測(cè),利用生物信息學(xué)方法對(duì)檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行分析,最終可 以獲得胚胎細(xì)胞中染色體數(shù)目的信息。本試劑盒對(duì)囊胚期活檢細(xì)胞樣本(3~10個(gè))進(jìn)行全基因組 擴(kuò)增,實(shí)現(xiàn)DNA模板從pg級(jí)到μg級(jí)的均一性放大與富集。接著,對(duì)全基因組擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行片段 化和接頭連接。然后,采用PCR擴(kuò)增的方法對(duì)片段化產(chǎn)物加入標(biāo)簽序列并實(shí)現(xiàn)文庫(kù)的富集。使用 XP磁珠完成對(duì)文庫(kù)的純化,獲得片段大小為200~700bp的文庫(kù)分子;對(duì)文庫(kù)進(jìn)行測(cè)序和數(shù)據(jù)分析,即可獲得胚胎細(xì)胞中23對(duì)染色體數(shù)目異常的信息。
胚胎細(xì)胞全基因組擴(kuò)增通過(guò)低擴(kuò)增偏好的方式進(jìn)行,以盡可能無(wú)偏倚地保持樣本原始DNA信息。擴(kuò)增分三步進(jìn)行:裂解,預(yù)擴(kuò)增和擴(kuò)增。對(duì)胚胎細(xì)胞裂解后,使用特殊結(jié)構(gòu)的隨機(jī)引物及配套組分對(duì)基因組進(jìn)行預(yù)擴(kuò)增,形成結(jié)構(gòu)相對(duì)穩(wěn)定的預(yù)擴(kuò)增產(chǎn)物,最后使用與預(yù)擴(kuò)增引物的非隨 機(jī)序列匹配的擴(kuò)增引物及配套組分對(duì)基因組進(jìn)行指數(shù)擴(kuò)增。
?本試劑盒結(jié)合可逆末端終止法高通量測(cè)序技術(shù)和生物信息學(xué)分析方法對(duì)胚胎囊胚期活檢細(xì) 胞中染色體數(shù)目異常進(jìn)行定性檢測(cè)??赡婺┒私K止測(cè)序技術(shù)的檢測(cè)過(guò)程包括:將不同熒光基團(tuán)標(biāo) 記的四種核苷酸以及DNA聚合酶同時(shí)加入流動(dòng)槽通道中,按堿基互補(bǔ)原理,合成互補(bǔ)的DNA 鏈;在堿基延伸過(guò)程中,每個(gè)循環(huán)反應(yīng)只能延伸一個(gè)正確互補(bǔ)的堿基,根據(jù)四種不同的熒光信號(hào) 確認(rèn)堿基種類(lèi),讀取該次反應(yīng)顏色后,堿基保護(hù)基團(tuán)被除去,下一個(gè)反應(yīng)可繼續(xù)進(jìn)行。最終,通 過(guò)對(duì)所有測(cè)序信號(hào)的分析,實(shí)現(xiàn)對(duì)DNA序列各個(gè)位點(diǎn)不同堿基的序列判定;并結(jié)合生物信息學(xué) 分析方法,對(duì)人類(lèi)染色體所屬的DNA片段數(shù)量進(jìn)行統(tǒng)計(jì),將統(tǒng)計(jì)的結(jié)果與大量正常樣本構(gòu)成的 參考集合相比較,即可獲得檢測(cè)樣本中所含染色體DNA片段數(shù)量是否存在異常的信息,從而實(shí) 現(xiàn)對(duì)人類(lèi)23對(duì)染色體數(shù)目異常的判斷,為臨床上選擇健康正常的胚胎提供輔助判斷。
【主要組成成分】

說(shuō)明:不同批號(hào)試劑盒中各組份不可以互換。
自備試劑及儀器:?
1. ? AgencourtAMPureXPkit(BeckmanCoulter貨號(hào):A63882)
2. ? QubitTMFluorometer(LifeTechnologies貨號(hào):Q33218)
3.??QubitTMdsDNAHSAssayKits或QubitTM1×dsDNAHSAssayKits(LifeTechnologies貨號(hào):Q33231)
4. ? QubitTMassaytubes(LifeTechnologies貨號(hào):Q32856)?
5.胚胎染色體異倍體分析系統(tǒng)(北京中儀康衛(wèi)醫(yī)療器械有限公司,版本號(hào):V1.01,醫(yī)療 器械注冊(cè)證書(shū)編號(hào):)
【儲(chǔ)存條件及有效期】
1.試劑盒A部分于-20±5℃保存:試劑盒B部分于2-8℃保存。
2.未拆封試劑盒在上述儲(chǔ)存條件下有效期為6個(gè)月,試劑盒中冷凍保存組分可允許的凍融 次數(shù)≤5次,建議開(kāi)封后的試劑盒在3個(gè)月內(nèi)使用完畢。?

【適用儀器】
MiSeqDx基因測(cè)序儀(Illumina)?

【樣本要求】
1.樣本類(lèi)型:
囊胚期滋養(yǎng)層細(xì)胞活檢樣本。?
2.樣本采集:
樣本的采集:按照《體外受精-胚胎移植實(shí)驗(yàn)室技術(shù)》(人民衛(wèi)生出版社,2012.2)中“11.4.4 囊胚滋養(yǎng)層細(xì)胞活檢”來(lái)操作,細(xì)胞采集數(shù)3-10個(gè)。在顯微鏡下,將活檢后的胚胎細(xì)胞使用新鮮 培養(yǎng)基洗滌2次,再使用PBS緩沖液洗滌3次,然后將洗滌后的細(xì)胞(約含0.5μL1×PBS緩沖液) 小心轉(zhuǎn)移至裝有2.0μL1×PBS緩沖液的PCR管中。
3.樣本保存:
-20±5℃保存時(shí)間不超過(guò)3個(gè)月;樣本反復(fù)凍融次數(shù)不超過(guò)1次。應(yīng)盡快進(jìn)行擴(kuò)增。
4.樣本運(yùn)輸:
干冰條件下運(yùn)輸;須確保樣本送達(dá)時(shí)有足夠的剩余干冰,且有緩沖裝置,避免樣本管在運(yùn) 輸過(guò)程中被干冰冰塊擠破。

【檢驗(yàn)方法】?
1.??? 全基因組擴(kuò)增
1.1細(xì)胞裂解
1)??? 將細(xì)胞樣本冰上解凍并瞬時(shí)離心30s,用1×PBS緩沖液補(bǔ)至2.5μL,同時(shí)用2.5μL1×PBS緩 沖液作為擴(kuò)增的空白對(duì)照;
2)??? 向細(xì)胞樣本及空白對(duì)照中加入2.5μL的裂解液,瞬時(shí)離心,置于冰盒上;
3)??? 根據(jù)下表,在離心管中依次加入試劑,對(duì)裂解酶進(jìn)行稀釋,并使用移液器反復(fù)吹打混勻, 置于冰盒上;

向細(xì)胞樣本、空白對(duì)照管以及對(duì)照品管中加入5μL上一步制備的細(xì)胞裂解液混合物,瞬時(shí)離 心(禁止振蕩);
注意:對(duì)照品包括對(duì)照品1、對(duì)照品2、對(duì)照品3
4)??? 在PCR儀上,按以下條件進(jìn)行反應(yīng):75℃10分鐘,95℃4分鐘,25℃保持。?
1.2預(yù)擴(kuò)增
1)??? 根據(jù)下表,制備全基因組預(yù)擴(kuò)增混合物,并使用移液器反復(fù)吹打混勻;

2)??? 向1.1制備的裂解物加入5μL上一步制備的全基因組預(yù)擴(kuò)增混合物,瞬時(shí)離心;
3)??? 在PCR儀上,按以下條件進(jìn)行反應(yīng):95℃2分鐘;
95℃ 15秒,15℃50秒,25℃ 40秒,35℃30秒,65℃40秒,75℃40秒;4℃保持;


4)??? 將全基因組預(yù)擴(kuò)增產(chǎn)物置于冰盒上。
1.3擴(kuò)增
1)??? 根據(jù)下表,制備全基因組擴(kuò)增混合物,并使用移液器反復(fù)吹打混勻;

2)??? 向1.2制備的全基因組預(yù)擴(kuò)增產(chǎn)物中加入上一步制備的全基因組擴(kuò)增混合物,顛倒混勻,瞬時(shí)離心;?
3)??? 在PCR儀上,按以下條件進(jìn)行反應(yīng):95℃2分鐘;
95℃15秒,65℃1分鐘,75℃1分鐘;4℃保持;
? ? ? ? ? ? ? 14個(gè)循環(huán)
?4)??? 反應(yīng)結(jié)束立即將樣本從PCR儀上取出,將擴(kuò)增產(chǎn)物置于冰盒上,直至進(jìn)行下一步操作。
5)??? 擴(kuò)增產(chǎn)物-20±5℃保存不超過(guò)2個(gè)月。?
1.4全基因組擴(kuò)增產(chǎn)物的質(zhì)量控制
1.4.1全基因組擴(kuò)增產(chǎn)物的濃度測(cè)定:濃度測(cè)定采用Qubit?Fluorometer系統(tǒng),檢測(cè)試劑為QubitTM
雙鏈DNA高靈敏度檢測(cè)試劑盒,具體操作步驟參照產(chǎn)品說(shuō)明書(shū)。細(xì)胞樣本及對(duì)照品的濃度范圍為
20-80ng/μL;如果空白對(duì)照的濃度<8ng/μL,表明空白對(duì)照質(zhì)量合格,將細(xì)胞樣本及對(duì)照品按照2、
3、4和5步驟進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建、測(cè)序和數(shù)據(jù)分析;如果空白對(duì)照的濃度≥8ng/μL,可對(duì)空白對(duì)照進(jìn)一步進(jìn)行人類(lèi)基因組比對(duì)率(mapratio)質(zhì)量評(píng)價(jià),按照1.4.2步驟進(jìn)行操作。
1.4.2對(duì)1.4.1步驟中濃度≥8ng/μL的空白對(duì)照擴(kuò)增產(chǎn)物分別按照2、3、4和5步驟進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建、 測(cè)序和數(shù)據(jù)分析,測(cè)序人類(lèi)基因組比對(duì)率(map ratio)值應(yīng)不高于50%。
??
2.??? 文庫(kù)構(gòu)建
2.1? ?擴(kuò)增產(chǎn)物片段化和標(biāo)記
1)??? 預(yù)先取出轉(zhuǎn)座酶混合液和轉(zhuǎn)座酶緩沖液,將其置于冰盒上,融化后充分振蕩混勻,瞬時(shí)離 心;將轉(zhuǎn)座中和液恢復(fù)到室溫,振蕩混勻并確保沒(méi)有沉淀;
2)??? 將全基因組擴(kuò)增產(chǎn)物稀釋至0.2ng/μL,渦旋振蕩15秒,瞬時(shí)離心;
3)??? 根據(jù)下表在0.2mLPCR管中依次加入試劑,并用移液器吹打混勻;
4)??? 將上步反應(yīng)液振蕩混勻15秒,瞬時(shí)離心,在PCR儀上按以下條件進(jìn)行反應(yīng):
55℃ 5分鐘;10℃保持;
5)??? 當(dāng)反應(yīng)達(dá)到10℃時(shí),取出反應(yīng)管立即加入5μL轉(zhuǎn)座中和液,振蕩混勻15秒,瞬時(shí)離心,室溫放置5分鐘。
2.2????? PCR擴(kuò)增
1)??? 預(yù)先取出PCR擴(kuò)增試劑和標(biāo)簽序列,室溫融化后充分振蕩混勻,瞬時(shí)離心;
2)??? 根據(jù)下表,在上一步片段化反應(yīng)管中依次加入以下試劑;

?

3)??? 將反應(yīng)液振蕩混勻15秒,瞬時(shí)離心,在PCR儀上按以下條件進(jìn)行反應(yīng):
72℃ 3分鐘;95℃ 30秒,95℃ 10秒,55℃ 30秒,72℃ 30秒;72℃5分鐘,4℃保持。


提示:
????? 加入標(biāo)簽序列時(shí)須反復(fù)核對(duì)
????? 每次只打開(kāi)一個(gè)管蓋,謹(jǐn)防標(biāo)簽序列交叉污染
2.3????? PCR產(chǎn)物純化
1)??? 預(yù)先取出AMPureXP磁珠,室溫平衡30分鐘,渦旋振蕩1分鐘,充分混勻;
2)??? 按樣本量配制80%的乙醇(80%乙醇須新鮮配制,配制量為500μL/樣本),顛倒混勻;
3)??? PCR反應(yīng)結(jié)束后,取出PCR管,瞬時(shí)離心,加入50μL磁珠,渦旋振蕩5秒,靜置5分鐘,瞬 時(shí)離心,再置于磁力架上靜置至液體澄清,小心吸棄上清;
4)??? 加入200μL新鮮配制的80%乙醇,慢慢轉(zhuǎn)動(dòng)離心管兩圈,讓磁珠滾動(dòng)起來(lái),再將離心管置于 磁力架上靜置,待液體澄清后,小心吸棄上清;
5)??? 重復(fù)步驟4)1次,進(jìn)行第2次乙醇洗滌;
6)??? 將離心管從磁力架上取出,瞬時(shí)離心,再放回磁力架上,用移液器將殘余的乙醇吸走,敞開(kāi)管蓋,室溫晾干≤5分鐘;
重要提示:
????? 如磁珠過(guò)濕須延長(zhǎng)室溫晾干時(shí)間
????? 避免磁珠過(guò)度干燥,如磁珠有裂紋出現(xiàn)須蓋好管蓋,并立即進(jìn)行下步試驗(yàn)操作
7)??? 將離心管從磁力架上取出,加入30μLDNA重懸液,吹吸5~10次將磁珠完全懸浮,渦旋振蕩5秒,靜置5分鐘,瞬時(shí)離心。將離心管放置于磁力架上靜置至澄清,吸取全部上清轉(zhuǎn)移到1.5mL管中,即為純化好的文庫(kù)。
注意:不要吸取磁珠。
8)??? 用Qubit方法測(cè)定文庫(kù)濃度,具體操作方法見(jiàn)操作步驟1.4;文庫(kù)濃度不得低于0.6ng/μL。
3.??? 測(cè)序模板制備
3.1? ?混合文庫(kù)
1)??將文庫(kù)稀釋到2nM,稀釋倍數(shù)=文庫(kù)濃度(ng/μL)×1515/450÷2(nM),具體操作如下:

稀釋后渦旋振蕩15秒,瞬時(shí)離心;
2)? ?將每個(gè)稀釋至2nM的文庫(kù)各取5μL加入至同一個(gè)1.5mL離心管中,渦旋振蕩15秒,瞬時(shí)離心 即為混合文庫(kù)。
3.2? ?文庫(kù)變性
1)? ?將混合文庫(kù)混合均勻,根據(jù)下表在1.5mL離心管中依次加入試劑,渦旋振蕩15秒,瞬時(shí)離心:

?

室溫放置5分鐘,在上步變性管中加入980μL的雜交緩沖液,混勻,瞬時(shí)離心;
2)? ?文庫(kù)變性后濃度為20pM,進(jìn)一步用雜交緩沖液稀釋到12pM-15pM,根據(jù)下表比例進(jìn)行稀 釋,稀釋后渦旋振蕩15秒,瞬時(shí)離心,即為上機(jī)文庫(kù)。

4. ?? 上機(jī)測(cè)序 使用適用機(jī)型基因測(cè)序儀(MiSeqDx),按照儀器標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)程進(jìn)行檢測(cè)。
5.??? 測(cè)序數(shù)據(jù)分析 將測(cè)序獲得的序列信息數(shù)據(jù)傳輸至《胚胎染色體異倍體分析系統(tǒng)》(北京中儀康衛(wèi)醫(yī)療器械有限公司研制及生產(chǎn))運(yùn)行分析,獲得判讀結(jié)果。
1)統(tǒng)計(jì)質(zhì)控信息
人類(lèi)基因組(human assemblyGRCh37/hg19))比對(duì)后的原始數(shù)據(jù)使用samtools剔除基因組重復(fù)區(qū)域的序列(Reads),以避免重復(fù)序列對(duì)分析結(jié)果造成影響。同時(shí)去除比對(duì)質(zhì)量(Map?Quality)低于8、多匹配和非完全匹配到染色體上的堿基序列,以確保測(cè)序數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性以及每條堿基序列定位的唯一性,從而得到有效序列。根據(jù)得到的序列,統(tǒng)計(jì)樣本中唯一匹配序列數(shù)(UniqueReads)、堿基覆蓋度(Coverage)、序列總數(shù)(Total reads)、線粒體比例(MT Ratio)、比對(duì)率(MapRatio)、冗余度(Duplication)和GC含量(GCRatio)等。
2)GC校正 將上一步得到的有效序列分配到事先劃分好的200kb片段大小的基因組非重疊區(qū)域(窗口)中,然后進(jìn)行GC校正,詳細(xì)步驟為:首先計(jì)算每個(gè)窗口區(qū)域的基因組GC含量;然后以樣本所有窗口的序列數(shù)平均數(shù)與該GC含量水平內(nèi)窗口序列平均數(shù)的比值作為窗口GC校正權(quán)重,重新計(jì)算窗口序列含量(Reads Count,RC)。
3)均一化校正 對(duì)每個(gè)樣本測(cè)序數(shù)據(jù)量進(jìn)行均一化后計(jì)算窗口的檢測(cè)信號(hào)值(RCid),計(jì)算公式如下:

RCi為染色體第i個(gè)窗口的RC值;正常樣本RCid理論值為20。
4)隱馬爾可夫模型分區(qū)
經(jīng)過(guò)校正的檢測(cè)信號(hào)值,使用隱馬爾可夫模型(HiddenMarkovModel,HMM)計(jì)算判定其 異倍性。設(shè)定染色體狀態(tài)為五種:0、10、20、30和40,分別代表缺失、單倍體、二倍體、三倍 體和四倍體。相同狀態(tài)間的轉(zhuǎn)移概率設(shè)為0.999,不同狀態(tài)間的轉(zhuǎn)移概率為0.00025。通過(guò)統(tǒng)計(jì)已 知核型樣本的各窗口RCid值,計(jì)算得到HMM計(jì)算中所需要的發(fā)射概率矩陣,通過(guò)轉(zhuǎn)移概率矩陣 和發(fā)射概率矩陣及校正后樣本的RCid值計(jì)算樣本中各染色體片段的拷貝數(shù)狀態(tài)概率,預(yù)測(cè)每個(gè)片 段區(qū)域的拷貝數(shù)狀態(tài)。根據(jù)連續(xù)片段區(qū)域的狀態(tài)對(duì)片段區(qū)域進(jìn)行分區(qū)。
5)判斷結(jié)果
計(jì)算染色體所包含窗口檢測(cè)信號(hào)值(RCid)的平均值作為整條染色體的檢測(cè)信號(hào)值(RCid),根據(jù)參考范圍判斷染色體拷貝數(shù),生成報(bào)告結(jié)果,修改數(shù)據(jù)分析狀態(tài),并將分析結(jié) 果返回到報(bào)告查看界面。計(jì)算分區(qū)信號(hào)值(RCid),根據(jù)參考范圍判斷分區(qū)拷貝數(shù),若為異常則進(jìn)行提示。
6)查看報(bào)告
a)? 若檢測(cè)樣本中的某條染色體的RCid值≥26.97或≤12.97,則表示該樣本的該染色體存在 非整倍體異常,否則表示該次檢測(cè)未發(fā)現(xiàn)非整倍體異常。
b) ?若某條染色體的RCid值為0,應(yīng)判定為此樣本未檢測(cè)出該染色體,同時(shí)對(duì)于常染色體而言,此種檢測(cè)結(jié)果為陽(yáng)性純合缺失,對(duì)于性染色體而言,此種檢測(cè)結(jié)果應(yīng)將X、Y檢測(cè)結(jié)果共同判斷;
c)對(duì)于X、Y染色體檢測(cè)結(jié)果應(yīng)共同判斷,若X染色體檢測(cè)結(jié)果為單體同時(shí)Y染色體檢測(cè)結(jié) 果為單體,則此樣本X、Y染色體檢測(cè)結(jié)果應(yīng)判定為未發(fā)現(xiàn)非整倍體異常,不能分別判定為單體 陽(yáng)性(非整倍體異常);
d) ?本產(chǎn)品對(duì)于某些染色體多倍體陽(yáng)性的情況,檢測(cè)結(jié)果均表示為三體陽(yáng)性。
6.??? 質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)
6.1 ??每個(gè)樣本的唯一比對(duì)有效數(shù)據(jù)量(reads數(shù))≥1M;
6.2 ??每個(gè)樣本的基因組覆蓋度≥4%;
6.3 ??對(duì)照品1的檢測(cè)結(jié)果為21號(hào)染色體三體;
6.4 ??對(duì)照品2的檢測(cè)結(jié)果為性染色體單體;
6.5 ??對(duì)照品3的檢測(cè)結(jié)果為陰性。
以上需要同時(shí)滿足。
?
【參考范圍】
通過(guò)Z值法確定樣本參考范圍,并經(jīng)350例陰性囊胚活檢樣本和400例陽(yáng)性囊胚活檢樣本測(cè)序分驗(yàn)證,計(jì)算每個(gè)樣本的24條染色體的RCid值,最終確定參考值的范圍。對(duì)于臨界值樣本,我 們通過(guò)對(duì)臨床樣本及企業(yè)參考品進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,從而得出臨界值范圍的上下限。
根據(jù)本試劑盒的研究資料,確定樣本染色體RCid值的參考范圍如下表所示。


【檢驗(yàn)結(jié)果的解釋】?
1. ?? 常染色體:常染色體的Rcid≤12.97或RCid≥26.97,分別表明檢測(cè)樣本的該條染色體為單體或三體(某條染色體多倍體陽(yáng)性的情況,檢測(cè)結(jié)果均表示為三體),即該條染色體存在非 整倍體異常。
2. ?? 性染色體:當(dāng)X染色體的RCid值為12.97<RCid<26.97,且Y染色體的RCid值為0;或X、Y 染色體的Rcid值均≤12.97且不為0時(shí),表明性染色體未見(jiàn)非整倍體異常,其他情況均為存在 非整倍體異常。
3. ?? 當(dāng)任意1條染色體的RCid值為23.17<RCid<26.97或者12.97<RCid<17.90時(shí),表明該染色體 為二體,但可能存在染色體片段異常或嵌合風(fēng)險(xiǎn),可結(jié)合其他臨床指征處理。
?
【檢驗(yàn)方法的局限性】
1.本試劑盒只用于檢測(cè)染色體數(shù)目異常,檢出結(jié)果僅供臨床參考,不能單獨(dú)作為確診或者排除病據(jù)。
2.試劑盒能用于妻一為平衡位、染體結(jié)構(gòu)異常等成的胚染色結(jié)構(gòu)變的?測(cè)。
3.對(duì)于小于等于4M的染色體拷貝數(shù)變異及嵌合比例不大于30%嵌合體樣本,本試劑盒檢出率 較低。
4.本試劑盒不能檢測(cè)單倍體、三倍體、多倍體等全部染色體整倍增加或減少的異常。
5.在少數(shù)情況下,鑒于當(dāng)前醫(yī)學(xué)檢測(cè)技術(shù)水平、個(gè)體差異以及樣本運(yùn)輸?shù)仍?,可能?dǎo)致部 分胚胎樣本無(wú)法檢測(cè)。

【產(chǎn)品性能指標(biāo)】
國(guó)家參考品/企業(yè)參考品檢測(cè)
1.建庫(kù)質(zhì)量?
采用國(guó)家參考品或經(jīng)標(biāo)化的企業(yè)參考品,試劑盒文庫(kù)構(gòu)建失敗率不超過(guò)3.0%。
2.數(shù)據(jù)量控制?
采用數(shù)據(jù)量控制國(guó)家參考品或經(jīng)標(biāo)化的企業(yè)參考品,檢測(cè)的唯一比對(duì)有效數(shù)據(jù)量應(yīng)不低于1M,基因組覆蓋率不低于4%。在滿足建庫(kù)質(zhì)量和數(shù)據(jù)量控制前提下,達(dá)到下列技術(shù)指標(biāo):
3.陽(yáng)性參考品符合率?
采用國(guó)家參考品或經(jīng)標(biāo)化的企業(yè)參考品,異常片段大小大于4M的陽(yáng)性參考品對(duì)應(yīng)的染色體異要求檢出率達(dá)到100%,異常片段大小小于等于4M的陽(yáng)性參考品對(duì)應(yīng)的染色體異常檢出率要求 達(dá)到50%以上。
4.陰性參考品符合率?
采用國(guó)家參考品或經(jīng)標(biāo)化的企業(yè)參考品,陰性參考品應(yīng)不得檢出染色體異常。
5.嵌合體參考品符合率
采用國(guó)家參考品或經(jīng)標(biāo)化的企業(yè)參考品,對(duì)30%嵌合的嵌合體樣本檢出率應(yīng)達(dá)到30%以上, 70%嵌合體樣本檢出率應(yīng)達(dá)到60%以上。
6.重復(fù)性
高通量測(cè)序檢測(cè)系統(tǒng)使用同一批次試劑盒進(jìn)行三次重復(fù)試驗(yàn),要求三次試驗(yàn)結(jié)果在滿足建庫(kù)質(zhì)量和數(shù)據(jù)量控制前提下,每次均滿足1-5 檢測(cè)要求。
7.臨床試驗(yàn)情況
臨床試驗(yàn)采用對(duì)比驗(yàn)證試驗(yàn)設(shè)計(jì),每例納入統(tǒng)計(jì)的樣本均采用本試劑盒和金標(biāo)準(zhǔn)對(duì)比驗(yàn)證方法進(jìn)行檢測(cè)。染色體非整倍體陽(yáng)性金標(biāo)準(zhǔn)對(duì)比驗(yàn)證方法為熒光原位雜交(FISH);染色體非整倍體陰性金標(biāo)準(zhǔn)對(duì)比驗(yàn)證方法為染色體核型分析,包括產(chǎn)前診斷羊水穿刺核型分析、流產(chǎn)組織核 型分析。
本試劑盒臨床試驗(yàn)篩選1221對(duì)受試者夫妻入組并完成檢測(cè),在1221對(duì)受試者夫妻的4640例胚胎樣本中,檢測(cè)出染色體非整倍體陽(yáng)性1494例,染色體非整倍體陰性3135例。陽(yáng)性樣本FISH驗(yàn)證533例,陰性樣本隨訪到核型分析檢查結(jié)果223例。通過(guò)對(duì)受試者和胚胎的基線特征分析,表明本臨床試驗(yàn)的受試者及胚胎能夠代表臨床的實(shí)際情況,本試劑盒已驗(yàn)證樣本的統(tǒng)計(jì) 分析結(jié)果具有臨床意義。統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果顯示,與金標(biāo)準(zhǔn)對(duì)照方法相比,本試劑盒檢測(cè)胚胎染色體非整倍體的靈敏性為100%(95%CI:99.00%-100%),特異性為98.2%(95%CI:95.6%~99.5%),準(zhǔn)確性為99.5%(95%CI:98.7%~99.9%);本試劑盒檢測(cè)胚胎染色體非整倍 體的陽(yáng)性預(yù)測(cè)值為99.2%(95%CI:98.1%~99.8%),陰性預(yù)測(cè)值為100.0%(95%CI:98.4%~ 100.0%);進(jìn)行Kappa一致性檢驗(yàn),Kappa=0.99(p<0.01)),顯示本試劑盒與金標(biāo)準(zhǔn)對(duì)照方法具有良好的檢測(cè)一致性。
?
【注意事項(xiàng)】?
1.本產(chǎn)品僅用于體外診斷。
2.臨床實(shí)驗(yàn)室應(yīng)嚴(yán)格按照《醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室管理辦法》(衛(wèi)辦醫(yī)政發(fā)(2010)194號(hào))等有關(guān)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室、臨床基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室的管理規(guī)范執(zhí)行。試驗(yàn)人員必須進(jìn)行專業(yè)培訓(xùn),嚴(yán)格按照說(shuō)明書(shū)操作,按照試驗(yàn)過(guò)程嚴(yán)格分區(qū)進(jìn)行(試劑準(zhǔn)備區(qū)、標(biāo)本制備 區(qū)、擴(kuò)增和產(chǎn)物分析區(qū)),試驗(yàn)操作的每個(gè)階段使用專用的儀器和設(shè)備,各區(qū)各階段用品不能交叉使用。
3.操作注意安全防護(hù)。樣品提取應(yīng)在規(guī)定的實(shí)驗(yàn)場(chǎng)所進(jìn)行,穿戴防護(hù)衣物、一次性手套和口 罩,所有直接接觸過(guò)樣品的物體應(yīng)進(jìn)行消毒后丟棄或再次使用。
4.所使用的接觸試劑的材料均要求干燥、潔凈,以防止污染。試驗(yàn)過(guò)程中所涉及的耗材為一 次性使用,不得重復(fù)使用。
5.使用前,液體試劑應(yīng)混合均勻,盡量避免反復(fù)凍融。
6.操作過(guò)程中,盡量減少熒光試劑的曝光時(shí)間。
7.本試劑一次性使用,不同批號(hào)試劑禁止交叉使用,請(qǐng)勿使用過(guò)期試劑。
??
【基本信息】
注冊(cè)人/生產(chǎn)企業(yè)名稱:北京中儀康衛(wèi)醫(yī)療器械有限公司
住所:北京市大興區(qū)中關(guān)村科技園區(qū)大興生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)基地天榮街19號(hào)院6幢204室?
聯(lián)系方式:010-68056969
售后服務(wù)單位名稱:北京中儀康衛(wèi)醫(yī)療器械有限公司?
聯(lián)系方式:010-68056969
生產(chǎn)地址:北京市大興區(qū)中關(guān)村科技園區(qū)大興生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)基地天榮街19號(hào)院6幢204室
【醫(yī)療器械生產(chǎn)企業(yè)許可證編號(hào)】
【醫(yī)療器械注冊(cè)證書(shū)編號(hào)】
【產(chǎn)品技術(shù)要求編號(hào)】
【說(shuō)明書(shū)核準(zhǔn)及修改日期】
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