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1小時出結(jié)果!張鋒團(tuán)隊發(fā)布新冠病毒CRISPR檢測技術(shù)

日期:2020-02-17
瀏覽量:2233

最近的新型冠狀病毒(COVID-19)爆發(fā),給全球衛(wèi)生帶來了巨大的挑戰(zhàn)。為了支持戰(zhàn)“疫”,2月14日,美國麻省理工學(xué)院Broad研究所聯(lián)合哈佛大學(xué)、麻省理工學(xué)院McGovern研究所以及其相關(guān)合作機(jī)構(gòu)宣布,免費(fèi)提供可能有用的信息,包括通過共享可能支持潛在診斷技術(shù)發(fā)展的信息。



這其中,就包括CRISPR基因編輯大神張鋒教授、Omar Abudayyeh和Jonathan Gootenberg開發(fā)的一種基于CRISPR的診斷COVID-19技術(shù)的詳細(xì)操作流程文檔。



目前,新型冠狀病毒可以通過qPCR進(jìn)行診斷,但是由于缺乏試劑和設(shè)備,疾病檢測進(jìn)展緩慢。基于CRISPR的COVID-19診斷技術(shù)利用的是張鋒教授團(tuán)隊2017年發(fā)布的SHERLOCK技術(shù)。此前,基于CRISPR-Cas13的SHERLOCK系統(tǒng)已經(jīng)被證明可以準(zhǔn)確地檢測出病人樣本中存在的大量不同病毒。該系統(tǒng)搜索唯一的核酸特征,并使用類似于驗(yàn)孕紙的試紙來提供一個可視的讀數(shù)。將試紙浸入準(zhǔn)備好的樣品后,試紙上會出現(xiàn)一條線,表明是否存在病毒。


基于這個理論,研究小組利用合成的COVID-19 RNA片段,設(shè)計并測試了兩種識別COVID-19兩個特征的向?qū)NA。一種識別新冠病毒的S基因,另一種識別Orf1ab基因。當(dāng)它們與Cas13蛋白結(jié)合時,就形成了一個能夠檢測COVID-19病毒RNA的SHERLOCK系統(tǒng)。

通過條帶位置的不同,很容易就能確認(rèn)新冠病毒是否存在。


該系統(tǒng)具有特異的高靈敏度,每微升里僅10-100個病毒拷貝,就可以被檢測出來。且步驟簡單,只需三步,一小時內(nèi)就可以完成檢測:



·?利用常規(guī)的42℃同溫擴(kuò)增技術(shù),對提取的核酸樣本進(jìn)行擴(kuò)增。這一步需要25分鐘。


·?在步驟1的樣本中加入Cas13蛋白、向?qū)NA以及起到報告作用的特殊分子,在37℃下繼續(xù)反應(yīng)30分鐘。


·?使用試紙對步驟2中獲得的樣本進(jìn)行檢測,結(jié)果應(yīng)該在5分鐘內(nèi)出現(xiàn)。


值得注意的是,這一技術(shù)尚未在患者樣本上進(jìn)行驗(yàn)證。任何診斷都需要開發(fā)和驗(yàn)證才能供臨床使用。張鋒教授團(tuán)隊歡迎研究人員與他們合作,并可以提供一個初學(xué)者工具包來測試該系統(tǒng)。如有可能,也可供檢測COVID-19樣本的研究人員使用。


附技術(shù)文檔全文:











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